Estudos de modelagem molecular em derivados de acrilamida como inibidores de serina protease viral NS3/NS2B do vírus da dengue

Resumo

A dengue é uma doença infecciosa aguda transmitida pelo mosquito do gênero Aedes, sendo que as áreas de maior incidência no mundo são regiões tropicais e subtropicais. Não existem tratamentos específicos contra o vírus da dengue, sendo apenas tratados os sintomas decorrentes da doença. A enzima NS3/NS2B serino protease é essencial para o ciclo de vida do vírus e um alvo promissor para o desenvolvimento de fármacos contra o vírus. Neste trabalho foram estudados compostos derivados da acrilamida obtidos da literatura, no qual foram submetidos a estudos de modelagem molecular. Através dos resultados de energia de afinidade e das interações de hidrogênios obtidas pela docagem molecular, e dos valores da constante de inibição obtidos a partir de testes experimentais foram selecionados três ligantes que fizeram interação de hidrogênio com os resíduos de aminoácidos His51, Ser135, Asp75, Gly151 e Gly153. Deste modo, simulações de dinâmica molecular foram realizadas com os três ligantes usando o método híbrido Química Quântica/Mecânica Molecular (QM/MM - Quantum Mechanics/Molecular Mechanics), no qual se observou pelo gráfico do RMSD (Raiz do Desvio Médio Quadrático - Root Mean Square Deviation) que o sistema se estabilizou no tempo de 10ns. Além disso, através dos gráficos de interação por resíduo foi observado que os resíduos chaves para a estabilização no sítio de ligação da enzima da dengue foram os resíduos de Ser34, Trp50, Lys73 e Gly151.